Područje Jajca ima umjereno-kontinentalnu klimu sa toplim ljetima i ne suviše dugim ali hladnim zimama. Ljeta karakterizira veća količina padavina, često u vidu jakih pljuskova, a zime velike količine padavina u obliku snijega.

Prosječna godišnja temperatura zraka u Jajcu je 10,1 °C. Prosječna januarska temperatura zraka je -2 °C, dok julska temperatura iznosi 18,6 °C. Ljetne temperature su relativno visoke pa je jesen toplija od proljeća. Proljetne temperature su niže jer se znatan dio sunčeve energije troši na rastapanje snježnog pokrivača.

Općina Jajce i grad Jajce spadaju u kišno područje, koje godišnje dobiva između 800 i 1.000 mm padavina (prosječno 939 mm). Najviše padavina u Jajcu imaju mjeseci juni i oktobar, a najmanje mjesec mart. Padavine, koje se izliju tokom juna i ostalih ljetnih mjeseci imaju pljuskovit karakter. Jesen je godišnje doba sa najvećom količinom padavina (263 mm). Srednja relativna vlažnost zraka je 78 %, broj oblačnih dana tokom godine je 133 i daleko je veći od broja vedrih dana, kojih tokom godine u Jajcu ima samo 42. Oblačnost je najveća tokom jesenjih mjeseci, a najmanja ljeti i u proljeće, jer nakon kratkotrajnih i jakih ljetnih pljuskova nastupa brzo razvedravanje.

Broj dana sa maglom najveći je u jesenjim mjesecima, a najmanji u proljetnim mjesecima. Ovo je posljedica prirodnih karakteristika općine, kao i veće zatvorenosti doline rijeke Vrbasa na teritoriji općine. U jesenjim mjesecima magle su često posljedica temperaturnih inverzija. Povećan broj maglovitih dana u augustu (7) je posljedica intenzivnog isparavanja u toku tog mjeseca i to tokom dana, te spuštanja hladnije zračne struje tokom noći sa planinskog oboda u nizinske dijelove. Magloviti dani u mjesecu augustu samo su kratkotrajna jutarnja pojava.

Jajce se nalazi pod utjecajem tri izrazito jake zračne struje. Najdominantnija je sjeverozapadna (21,3%), a zatim južna (21,0%) i nešto manje zastupljena sjeverna (20,5%). Ovakve zračne struje su posljedica regionalnih karakteristika oblasti, od kojih su dominantne: orjentacija doline Vrbasa, orjentacija doline Plive i njenih jezera i dinarske direktrise krupnih jedinica reljefa u planinskom prostoru. Lokalne odlike reljefa, odnosno smještaj Jajca i drugih naselja u proširenju doline Vrbasa, uslovljava pojavu lokalnih zračnih struja u smislu smjene vjetrova ,,danika” i ,noćnika”. ,,Danik” puše iz doline prema planinskom okviru, a ,,noćnik” sa planinskog okvira prema dolini. “Danik” je posljedica dnevnih temperaturnih karakteristika, a “noćnik” noćnih temperaturnih karakteristika kraja.

Na navedene specifične klimatske karakteristike Jajca utječe reljef sa svojom vegetacijom i energijom, prisustvo površinskih voda, njihova razvijenost i kapacitet (Plivska jezera i rijeke Vrbas i Pliva), kao i izgrađenost u prostoru tj. pokrivenost stambenim i nestambenim objektima.